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Vincent Zoete

Société / Institution

  • Université de Lausanne (UNIL), Faculté de biologie et de médecine (FBM)
  • Institut suisse de bioinformatique (SIB)
  • Institut Ludwig

Position actuelle

  • Professeur assistant en prétitularisation conditionnelle de l’UNIL
  • Directeur du Groupe de Modélisation moléculaire du SIB

Parcours

  • Diplôme d'ingénieur, Master en Drug Design et Doctorat en chimie organique à Lille.
  • Post-doctorat en modélisation moléculaire et conception de médicaments dans le groupe du Prof Karplus (Prix Nobel de chimie 2013) à Strasbourg, puis à Bâle.
  • Rejoint l'Institut suisse de bioinformatique en 2004 ; nommé Chef de groupe adjoint du Groupe de modélisation moléculaire en 2011. Professeur assistant au Département d'oncologie fondamentale de l'UNIL / Institut Ludwig depuis 2017 et Directeur scientifique de la Plateforme de modélisation des protéines (PMF).
  • En collaboration avec le Prof. O. Michielin, responsable du projet SwissDrugDesign du SIB qui consiste en une série d’outils en ligne gratuits pour la conception de médicaments assistée par ordinateur. Actif en ingénierie des protéines, a participé à la conception de récepteurs de lymphocytes T optimisés pour l’immunothérapie du cancer.
  • Impliqué dans l’enseignement de la conception de médicaments assistée par ordinateur avec le projet Atelier-drug-design.ch.

Centres d’intérêts en lien avec la santé personnalisée

Le travail de Vincent Zoete vise une meilleure compréhension des relations entre structure et activités des molécules, protéines ou médicaments. Depuis 2016, il est en charge avec son équipe, pour le Molecular Tumor Board du Réseau romand d’oncologie, de prédire l’effet de mutations sur la structure et l’activité de protéines présentes dans des cellules cancéreuses, lorsque ces mutations n’ont pas encore été caractérisées expérimentalement. Le but de ces analyses est de prédire si ces mutations sont pathogènes, et pourraient donc conduire à un traitement personnalisé, ou si elles sont au contraire inoffensives.

Projets de recherche en cours

Histoires de médecine personnalisée.

Projet financé par la Fondation Leenaards dans le cadre de l’initiative Santé personnalisée et société.

Stéphane Wicky, Vincent Zoete, Edoardo Missiaglia, Krisztian Homicsko

Ce projet associe journalistes et scientifiques pour illustrer les avancées que la médecine personnalisée promet dans la compréhension et le traitement du cancer et les espoirs qu’elle suscite chez les patients et leurs proches. A partir d’une émission « Antidote » diffusée sur les télévisions régionales seront déclinés d’autres outils d’information : brèves capsules vidéos, dossiers scientifiques vulgarisés, fascicule illustré pour le grand public, diffusion d’information via Facebook ou lors d’ateliers interactifs.

Conception de récepteur de lymphocytes T pour l’immunothérapie du cancer

Collaboration avec Prof. Olivier Michielin (SIB, CHUV, UNIL), Prof. George Coukos (CHUV, UNIL, Institut Ludwig), Dr. Melita Irving (UNIL, Institut Ludwig)

Conception d’outils Web pour l’analyse de mutations dans le cadre de Molecular Tumor Board

Collaboration avec Prof. Olivier Michielin (SIB, CHUV, UNIL)

Articles / Publications

Crippa, S., Ancey, P.-B., Vazquez, J., Angelino, P., Rougemont, A.-L., Guettier, C., et al. (2017). Mutant CTNNB1 and histological heterogeneity define metabolic subtypes of hepatoblastoma. EMBO Molecular Medicine, 9(11), 1589–1604.

Bonilla, X., Parmentier, L., King, B., Bezrukov, F., Kaya, G., Zoete, V., et al. (2016). Genomic analysis identifies new drivers and progression pathways in skin basal cell carcinoma. Nature Genetics, 48(4), 398–406.

Demierre, N., Zoete, V., Michielin, O., Stauffer, E., Zimmermann, D. R., Betticher, D. C., & Peters, S. (2013). A dramatic lung cancer course in a patient with a rare EGFR germline mutation exon 21 V843I: Is EGFR TKI resistance predictable? Lung Cancer (Amsterdam, Netherlands), 80(1), 81–84.

Gautschi, O., Peters, S., Zoete, V., Aebersold-Keller, F., Strobel, K., Schwizer, B., et al. (2013). Lung adenocarcinoma with BRAF G469L mutation refractory to vemurafenib. Lung Cancer (Amsterdam, Netherlands), 82(2), 365–367.

Irving, M., Zoete, V., Hebeisen, M., Schmid, D., Baumgartner, P., Guillaume, P., et al. (2012). Interplay between T cell receptor binding kinetics and the level of cognate peptide presented by major histocompatibility complexes governs CD8+ T cell responsiveness. Journal of Biological Chemistry, 287(27), 23068–23078.

Nikolaev, S. I., Rimoldi, D., Iseli, C., Valsesia, A., Robyr, D., Gehrig, C., et al. (2011). Exome sequencing identifies recurrent somatic MAP2K1 and MAP2K2 mutations in melanoma. Nature Genetics, 44(2), 133–139.

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